单细胞测序
分类: 最上层
发布时间: 2019-07-03 10:43
- 2013年度最重要的方法学进展
- 挑战基因测序的平均法则
单细胞测序
助力基因信息精细化解读
Single-cell sequencing
Better genomic interpretation
传统测序是以含有数百万细胞的混合DNA为样本;测序结果为一群细胞中信号平均值,或其中占优势数量的细胞信息,单细胞独有特性被忽视。
单细胞测序解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系及精细化解读相关基因信息等提供了新方向。
单细胞液态挑取技术优势:
- 挑取细胞为存活细胞
- 细胞未经过图片、固定、洗片等干扰,核酸更完整
- 单细胞获取过程简单,成本更低
- 手工操作即可,不需要专用显微切割仪
单细胞显微切割技术优势:
目的细胞更易发现:
可以通过FISH杂交和免疫荧光技术进行目的细胞鉴定
准确获得所需目的细胞:
使用高精度显微切割仪,能够更准确获得目的细胞
单细胞测序临床应用
肿瘤单细胞测序
利用单细胞全基因测序技术,了解癌细胞的基因突变,以及肿瘤的来源、肿瘤的生长规律、基因型等,为早期检测、肿瘤诊断和肿瘤的个体化治疗提供指导。
从单个肿瘤细胞水平对肿瘤单细胞进行测序,揭露出每个肿瘤细胞的突变规律,这将为药物研究、肿瘤的靶向治疗提供基础。
循环肿瘤细胞单细胞测试
通过对单个CTC分析,可以发现存在差异性基因表达模式,鉴定新的CTC候选生物标记物。此外,通过对CTC单细胞测序对细胞拷贝数变化进行检测,可以监控肿瘤转移。对不同病人的单个CTC谱进行分析,有希望利用CTC细胞的基因拷贝数对肿瘤进行分型。
体外受精的植入前遗传学诊断(PGD研究)
在植入前遗传学诊断和筛查领域,单细胞测序已经被用于体外受精前非整倍性和拷贝数变异的筛查。单细胞测序在PGD中的应用可以帮助医生选择整倍体的囊胚细胞进行植入。
单生殖细胞测序
单细胞DNA扩增技术和高通量测序技术的发明,使得测序单个生殖的基因组成为可能,利用单细胞全基因组测序技术来研究人类的染色体重组规律,具有以往技术无法比拟的优势。